Футбольный клуб «Велес», основанный всего 10 лет назад, в 2016 году, вырос на базе футбольной школы «Савёловская». В своем дебютном сезоне команда приняла участие в Первенстве России среди любительских футбольных клубов (III дивизион) в зоне «Москва» (МРО Центр), где заняла второе место. С сезона 2017/18 «Велес» получил возможность выступать в Первенстве ПФЛ в группе «Запад», завершив его на четвертой позиции.
Следующий сезон 2018/19 оказался для клуба более успешным, когда «Велес» финишировал на третьем месте. В сезоне 2019/20 руководство клуба поставило амбициозную задачу — выход в ФНЛ, что и было успешно выполнено: по итогам первой части первенства команда заняла первое место. Однако весной, из-за пандемии коронавируса, турнир не был возобновлён, и итоги были подведены на основе имеющихся результатов.
В последующие три сезона «Велес» выступал в ФНЛ, но в сезоне 2022–2023 команда вылетела во вторую лигу. Тем не менее, «Велесу» потребовалось всего три года, чтобы вернуться в первую лигу. На данный момент команду возглавляет главный тренер Алексей Стукалов, который продолжает тренерскую династию своего отца Бориса Стукалова. Ранее Алексей уже работал с «Крылатыми быками», а также в клубах из Саратова, Волгограда и Уфы.
Сегодня «Велес» встретится с ФК Енисей в рамках седьмого матча между этими командами в первенствах России. На данный момент у «Енисея» три победы, у «Велеса» — две, а один матч завершился вничью. Разница мячей в этих встречах составляет 8–7 в пользу красноярской команды.